2004年11月18日，随原兰州医学院并入兰州大学．把原兰州医学院护理系、原兰州医学院影像学专业并入基础医学院，原基础医学院临床医学专业划归新成立的临床医学院，2005年3年9日成立兰州大学基础医学院。所有本科生的前两年半均在基础医学院，而后两年半则转入临床医学院。

现有普通本专科学生831人，其中党员36人，入党积极分子400余人。

学院现有教职工174人，其中教学科研人员139人，实验技术人员23人，工勤人员3人，党政管理人员9人；教学科研人员中教授29人，青年研究员5人，副教授45人，讲师50人，萃英博士后6人，博士后4人。学院拥有中国工程院院士1人，“国家高层次人才特殊支持计划”领军人才1人，国家杰出青年科学基金获得者1人，国家百千万人才工程入选者1人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”（含跨世纪）4人，享受国务院特殊津贴专家5人，甘肃省领军人才6人，甘肃省“飞天学者”4人，甘肃省“高等学校教学名师奖”获得者4人，“萃英讲席教授”7人，甘肃省“333”、“555”人才工程第一、二层次人员9人。

学院现有一级学科博士点1个（基础医学）；省级重点一级学科2个（基础医学、中西医结合）；博士后流动站1个（基础医学博士后科研流动站）。

学院有教育部创新团队1个（“多肽药物”创新团队）；甘肃省重点实验室2个（甘肃省新药临床前研究重点实验室、甘肃省循证医学与临床转化重点实验室）；中国医学科学院创新单元2个（多肽研究创新单元、循证评价与指南研究创新单元）；甘肃省科技创新服务平台3个（甘肃省特殊人群遗传资源库、甘肃省实验动物质量检测与生物安全数字化仿真培训平台、西北及青藏高原群体和临床遗传资源共享平台）；甘肃省工程实验室1个（甘肃省智慧医疗工程实验室）；甘肃省国际科技合作基地1个（中医药标准转化与培训甘肃省国际科技合作基地）；国际合作联合实验室（WHO指南实施与知识转化合作中心）；甘肃省行业技术中心2个（甘肃省医学指南行业技术中心、甘肃省基因组医学行业技术中心）。

在科研方面，学院主要从事医药学领域的基础及应用基础研究。学院近年来主持国家重大科技专项1项；主持国家重大科技专项子项目2项；主持863项目1项，973子项目2项，主持国家自然科学基金重点项目3项。近5年主持国家重点研发计划项目2项，国家社科基金重大项目1项，国家自然科学基金面上项目14项，青年基金项目18项；甘肃省自然科学基金项目51项，其中重点项目2项，甘肃省创新群体2项，重点研发计划3项；以第一作者第一单位发表高水平论文共计423篇，自然指数（Nature Index）来源期刊收录论文22篇；授权国家发明专利39件，其中软件著作权5件。获国家自然科学奖二等奖1项，国家技术发明二等奖1项，何梁何利科学与技术创新奖1项，国家科技进步二等奖1项（参与）。

1946年秋，国立兰州大学医学院在西北医学院兰州分院的基础上成立，但未建立解剖学教研室。解剖课由中央医院眼耳鼻喉科主任李武功副教授等兼任。当时有助教1人，技术员2人。教学设备简陋，仅有少量尸体标本。1949年8月兰州市解放，同年9月，兰州大学医学院首届毕业生曾俊三留校任解剖学教师。至1953年，兰州大学医学院解剖学科分为两个教学组：大体解剖学组由曾俊三同志负责；组织胚胎学组由张爱诚同志负责，并领导全学科工作。两个组共有副教授1人，助教4人，技术员2人，工人2人。教学设备和标本有所增加。

1954年9月，原兰州医学院独立建院，并设人体解剖学教研室，在曾俊三主任领导下，开始编写解剖学教材，进行实验室建设。

1956—1962年，宫敬忠，黄志霖，陈浩德等同志先后调来解剖教研室工作，又有本院毕业生留校任解剖学教学工作，教师队伍逐渐扩大。在此期间，解剖教研室共有教师11人。宫敬忠任教研室主任，曾俊三、陈浩德任副主任。教研室开设了3个实验室，教学设备和尸体标本都有明显改善。曾经受卫生厅委托，解剖教研室举办过3期中级解剖师资班，学制一年，为省内各卫校培训师资队伍。1961年宫敬忠招收了我省第一个解剖专业研究生（刘恩芝，西北师大体育系退休），并创建了神经解剖学研究室，为教研室开展科研和培养研究生创造了良好条件。

1966—1976年，文革期间，解剖教研室与组织胚胎学、生理学、生物化学教研室合并，组建教学分队，进行开门办学。

1977—1985年，1977年高考统一招生的77级开始，在系统解剖学的基础上，又增设局部解剖学，广大教师的教学热情很高，不断探索教学改革，改进教学方法，提高教学质量。1979年人体解剖学和组织胚胎学成为学院最早具备医学硕士学位授予点的硕士点之一。1980年后，教研室将局部解剖学由教师示教标本，改为学生自己解剖操作尸体，有效地提高了教学效果。1982年后，学校实行多层次办学，招生规模扩大，解剖学教研室承担有临床医学，药学，预防医学，口腔医学的本科生和专科生解剖课。据1985年统计，教研室开设有5个实验室，每年承担约1081人次的授课任务，课时数达到3200学时以上。在此期间，教研室共有教师17人，技术员6人，工人1人，宫敬忠任教研室主任，宋景民、冯慎远任教研室副主任。

改革开放20年来，解剖教研室的教职员工在教学设备较简陋，教学条件较差，教学与科研经费紧张的条件下，勤奋工作，尽职尽责，不断探索教学改革，改进教学方法，努力提高教学质量，完成了繁重的教学任务。同时也克服了许多困难，积极开展科研工作，并取得了丰硕的科研成果。

尤其在九十年代后解剖学教研室得到了更进一步的发展，实验室建设更趋完善，同时加大了科研工作力度，加强了师资队伍建设。据1997年统计，该年度共完成了14种层次专业44个班次3722学时的解剖学教学任务，学生人数达到1144人次。

2004年11月18日兰州医学院并入兰州大学，成立兰州大学基础医学院人体解剖学教研室。人体解剖学教研室是学院最大的所，共有教师及教辅人员18名，其中教授3人，副教授1人，讲师4人，助教5人，中级教辅人员3人，初级教辅人员2人；10人具有硕士学位，2人具有博士学位。有中共党员13人。宋焱峰教授任教研室主任。教研室拥有10个多媒体教学实验室，承担着全校各系各专业的研究生、本科生和专科生的系统解剖学、局部解剖学、断层解剖学、神经科学、人体解剖生理学、人体解剖组织学、口腔解剖生理学和医学科学研究与论文等课程的教学工作。04年统计85个班，9678学时。学生人数达2300人次。同时，承接全省遗体捐献者的接待任务和尸体收集工作。每年收集25具左右尸体。

解剖学教研室共有5个科研方向：1.睡眠-觉醒周期变化的中枢调控。2.睡眠在学习、记忆中作用。3.神经毒-肉毒毒素临床应用的机理。4.脑疾病与神经营养。5.心脑血管疾病

人体解剖学教研室从建院至今已有五十多年的历史，先后共有50多位教师在本教研室工作。五十多年来教研室共培养硕士研究生50多名，各类本、专科学生数万名，学员遍布世界各地，为祖国医药卫生人才的培养作出了巨大的贡献。

免疫学研究所历史已逾半个世纪，属校内成立最早的基层教学与科研组织之一。1946年，由兰州大学医学系“细菌科”筹备成立微生物学教研室，当时教师只有沈彤笙教授、王文义教授、梁大伟助教三位教师，采用油印的由王文义教授主编的微生物学教材，这是我国西北地区医学微生物学和免疫学教学的开始。1950年增加车鸿德、邵明德二位技术人员，1951年赵紫绡老师来校任教，1953年刘文老师、王良明老师来校任教，1954年，兰州大学的医学系独立建院为兰州医学院，教研室命名为“兰州医学院微生物学教研室”。

1954年以前，每年级的学生为25-40人,由于学生人数少，教研室的职工人数少，完成的教学工作量也少。1970年以后，教研室的教学编制一直保持在10人左右，教学的工作量和教学水平逐年不断地有增加和提高。2003学年硕士研究生，本科生，专科生三个层次的教学工作量约120个教学班，理论和实验年教学学时达4000学时。

1981年11月国务院学位委员会批准病原生物学硕士点，并招收医学微生物学和免疫学方向硕士研究生，承担医学微生物学、医学免疫学本专科、研究生细胞与分子免疫学的教学，于2000年更名免疫学与微生物学教研室，2004年随着兰州医学院并入兰州大学，教研室改制为免疫学研究所，将医学微生物学课程从教研室分出，并入寄生虫教研室成立了病原生物学研究所，主要承担本专科、研究生的医学免疫学与微生物学、医学免疫学、临床免疫学与免疫学检验、细胞与分子免疫学的教学工作，经过几代人的努力，默默耕耘，几度春秋，在教学和科研上不断地走向成熟和发展，2003年9月国务院学位委员会批准免疫学硕士点，并开始招收医学免疫学专业硕士研究生。

经过六十多年的发展过程，在教学和科研等各方面都有了很大的提高和发展。现有4个教学实验室，另外有预备室、技术室、动物室及研究生科研实验室各1个。一次可接受4个教学实验班的教学任务。研究所有普通显微镜、冰箱、离心机、恒温箱、超净台等教学仪器和TC1825双层CO2孵箱、EF-4冷冻菌种干燥机、荧光显微镜、-20℃冰箱、酶联仪等专用仪器，科研实验室配备有相应的设备，具有细胞、分子水平的教学和科研条件。