医学院的科系和研究所，大致可分为临床医学和基础医学，临床医学部分包括了医学系、药学系、护理系、医技系，以培养医生、药师、护士、医检师、康复师等直接与维护人类生命安全有关职业的人才。而有时候药学系在大学中会独立成为药学院。

基础医学部分主要以培养医学方向的研究人才为主，研究的主要方向包括解剖学、病理学、微生物学、分子生物学、生物化学、药理学、法医学、放射医学等。医学院的院长通常由具有医师资格的教授来担任。