远征朝鲜的计划是由美国驻上海总领事乔治·西华德（George F. Seward，又译作“西华”）积极推进的。他在1868年先是从正准备赴朝盗墓的詹金斯那里听说朝鲜政府有意向和欧美修好，于是向他的叔叔、美国国务卿威廉·亨利·西华德（William H. Seward）提出向朝鲜派遣使节的建议；不久后谢南多厄号从朝鲜回来，他才明白詹金斯骗了他，朝鲜依然坚持闭关锁国，便又向国务卿西华德提议对朝鲜进行武力示威。此时正值美国政府换届，乔治·西华德的提案被搁置下来。1869年，格兰特就任新一届美国总统，汉密尔顿·菲什（Hamilton Fish）就任国务卿，镂斐迪（Frederick F. Low）出任驻华公使。新政府接受了乔治·西华德关于朝鲜问题的主张，在1870年4月20日授予镂斐迪出使朝鲜的全权资格，并让美国海军亚洲舰队司令约翰·罗杰斯（John Rodgers）少将负责护卫，任务是与朝鲜缔结一份遇难船员救助协定，如果条件允许的话可以进一步缔结通商条约，因此镂斐迪被要求同时参考1854年的《美日和亲条约》（神奈川条约）和1858年的《美日修好通商条约》，作为与朝鲜订立条约的蓝本。1870年11月，镂斐迪在北京与罗杰斯、乔治·西华德商量后，决定将远征朝鲜的出发时间定在1871年5月的上半月。

在美国国务院就朝鲜问题对镂斐迪的训令中，菲什还特别嘱咐要在事先征得朝鲜的宗主国——中国清朝的好意与调停。因此在1871年初，镂斐迪三次请求清朝总理衙门向朝鲜转递他的信函。前两次总理衙门都拒绝了，后来听说镂斐迪要带军舰过去，才认真对待此事，认为出于“关切属国之道”而应告知朝鲜，于是在1871年3月，清廷“通融”特许帮镂斐迪向朝鲜转递信函。镂斐迪在该信函中质问朝鲜为何要杀害舍门将军号的船员，并提及当年美国与日本缔约的契机也是日本虐待美国水手（拉戈达号事件），希望朝鲜也会同样以舍门将军号事件为契机和美国缔约（“自与日本国事同一律”）。镂斐迪虽然一面声称自己带军舰前来只是为了商办与交涉，“非耀威武”、“望以和睦”，然而另一面又扬言：“若多方拒绝，实召不睦，又谁尤焉？”暗示了美国不惜动用武力撬开朝鲜国门的炮舰政策。

朝鲜在4月10日接到了附带美国信函的清廷礼部咨文，朝鲜政府决定不回复美国信函，只回复礼部咨文，由艺文提学朴珪寿撰写。回咨中指出舍门将军号事件是美国凌虐朝鲜人在先，所以是其自招的；承诺将会救恤外国失事船员，但出于“人臣无外交”之义，作为中国属国的朝鲜没什么与美国可谈判的，更不会缔约通商，最后希望清政府“特降明旨，开谕该国使臣，以为破惑释虑，各安无事”。不过，朝鲜方面并未对美国信函中的武力威胁引起足够重视与警惕，5月11日从中国回来的使臣姜㳣在复命时还援引清廷礼部官员的话称“美船必不出去”。

镂斐迪不等朝鲜回信，就按原计划于5月远征朝鲜。美方动员了5艘军舰（含85门大炮）、1230名士兵。5艘军舰分别是：

镂斐迪在上海与罗杰斯会合后，于5月8日乘旗舰科罗拉多号等3艘军舰前往日本长崎，与停留在那里的另外两艘美国军舰会合。在日本政府的协助下准备就绪后，于5月16日开赴朝鲜。镂斐迪在长崎期间致国务卿菲什的报告中，将东方人的性格总结为狡诈，并强调“这很可能会妨碍使命的达成，从而导致武力冲突。至于到何种程度，则取决于朝鲜政府的行为和态度。……在与东方国家打交道时，对他们侮辱和伤害我们的行为一味姑息容忍是一种错误的政策。这种仁慈只会使他们错误地认为是因为我们恐惧才不去报复，并且助长其傲慢、狂妄和敌意”。镂斐迪的这种观点预示着这次远征将难免诉诸武力。

5月21日，美国舰队驶入朝鲜西海岸的南阳府海域，并于5月30日在富平府海域的芍药岛（勿淄岛）与虎岛之间抛锚。在此期间，朝鲜南阳府使申辙求等试图前往美舰“问情”，但只在途中遇到美国舰队的附属船只，双方人员因语言不通而各自归还。镂斐迪得知后，指示精通汉语的临时秘书兼翻译杜德绥（E. B. Drew，对朝鲜称“英汉文案总办”）向申辙求致函称：“此船系由大亚美理驾合众国即大美国来者，因我国钦差大人（镂斐迪）与朝鲜国大宪有商办事件，大约办妥尚需时日，本船在此海画一带停舶，竢事竢约，便回程舟次。”并派附属船只将此信递交再次“问情”的申辙求等。美国舰队抛锚之际，朝鲜又派了3名义州通事（汉语翻译）和1名仁川府邑吏来美舰传达回信，并告知将有3名三品官员来慰问美国人，美方反应尚算友好，向朝方赠送礼物，并在致朝方的回信中预告“拟令随带舟只前往上游，试探水势，以便酌夺大船驶上，并期谕知濒海居民，勿得惊恐，彼此以礼相待，决无害意，免生事端”。翌日，果然有3名朝鲜官员来访，经杜德绥用汉语询问得知他们没带委任状，镂斐迪嫌他们级别不够，拒绝接见，表示只接见具有协商权限的一品官员。同时，美方再度要求朝方在24小时内通知江华海峡沿岸官民不得妨碍美国船只测量附近海域的活动，这3名朝鲜官员不置可否，被美方看作是默认。

6月1日，朝鲜政府为防范美国舰队，任命鱼在渊为镇抚中军，带领京军前往江华岛。同日下午，美国不待朝鲜正式回复，就派军舰莫诺卡西号和帕罗斯号以及4艘汽艇闯入朝鲜的国防重地——江华海峡进行侦查，在黄昏时分经过江华海峡入口的孙石项（孙乭项）时，突然遭到朝鲜江华岛广城镇炮台的射击，其对岸的德浦镇也随之炮击美国军舰。美舰在向广城镇还击一阵后撤退。在此次冲突中，朝鲜有1人阵亡，美舰受损，2人受轻伤。

孙石项冲突后，朝鲜政府嘉奖了退敌有功的镇抚中军李凤亿（鱼在渊在6月3日才接任）等人，而美国则借口朝鲜侮辱星条旗，筹划报复攻击。由于美方兵力不足、对朝鲜水文和地形也不熟悉，所以放弃了征服朝鲜的计划，代之以集中攻击广城镇等曾炮击美舰的区域，又因为要等待对美舰有利的小潮出现，所以美军的报复攻击被推迟了9天。在这9天里，先是富平府使李基祖用竹竿向美方传递自己写的私信，质问其来意，并阐明朝鲜的闭关锁国政策；美方则回信谴责朝鲜无故攻击美舰，要求朝鲜道歉，否则美国将予以报复，同时强调美国只想与朝鲜友好谈判，无意占领朝鲜领土、变更朝鲜风俗。大院君让江华留守兼镇抚使郑岐源正式照会于美方，声明朝鲜是正当防卫以及不愿与外国交往，宣称“本国之不与外国交通，乃是五百年祖宗成宪，而天下之所共闻也，而亦大清天子之所俯烛，其不可破坏旧典”。6月7日，富平府使李基祖派通事赴美舰直接递交此照会，并附带4月朝鲜对清廷礼部的回咨副本，还送去牛和猪等作为食物。美方退回了牛和猪，并以杜德绥的名义送去最后通牒，表示朝鲜若在三、四日内没有表现出协商之意的话，后果自负。

不过朝鲜尚未觉察到问题的严重性，似乎也没有料到美国会展开报复攻击，在6月9日致美方的回复照会中除了重申朝鲜的观点外，也仅仅表示遗憾之意而已。朝鲜君臣在讨论美国问题时，领议政金炳学对年轻的国王高宗说：“所谓美利坚，只有部落而已。中间有华盛顿云者，开拓城池，建得基址，与海外洋夷互相通涉，而英吉利似是最近，此在《海国图志》矣。”高宗听了后表示：“此与海浪贼无异矣。”可见朝鲜方面也只是模糊地将正在迈向世界大国的美国视为一个部落或海盗团伙。

6月10日（农历四月二十三日）中午，450名美国海军陆战队士兵在莫诺卡西号军舰的猛烈炮火的掩护下登陆于江华岛草芝镇，展开了对朝鲜的报复性攻击作战。他们先在草芝镇安营扎寨，草芝佥使李濂见寡不敌众，在美军登陆时撤退到山谷里，当夜率军民袭击美军，但很快被美军赶走。6月11日上午，朝美双方全面交火，美军从草芝镇出发，先后进攻德津镇和广城镇，史载开战时“异船大炮，飞如雨柱，陆贼鸟铳，乱如雹下”。镇守广城镇的镇抚中军鱼在渊率军全力抵抗，并与美军展开白刃战，最后还是被优势火力的美军击溃，鱼在渊本人也以身殉国。战斗的结果是德津、广城两处要塞相继失守，而朝美双方对于阵亡人数的统计则有较大出入。朝鲜记载己方53人阵亡，24人受伤（其中4人重伤不治），不清楚美军损失；美国记载己方2人阵亡，10人受伤（其中1人重伤不治），打死243名朝鲜人，俘虏20人（但后来美方提供的俘虏名单为15人）。在破坏了这几处军事设施并缴获了50面军旗（包括鱼在渊的“帅”字旗）、481件火绳枪和抬枪等战利品以后，美军于翌日（6月12日）上午撤离江华岛，返回芍药岛停泊地。

遭到美国报复攻击后，朝鲜不但没有屈服，排外意志反而更加强化。美军撤离江华岛的当天，高宗在经筵上表示：“此夷（美国）之所欲和者，未知何事。而以若数千年礼义之邦，岂可与犬羊相和乎？虽几年相持，必痛绝乃已。若有以和字为言者，当施卖国之律矣！”侍讲的右议政洪淳穆极口称赞国王圣明，高宗命令将此番话公布于朝报中，令官民知晓他斥和攘夷的决心。摄政的大院君也下令将他在“丙寅洋扰”期间所写的十二字诀“洋夷侵犯，非战则和，主和卖国”刻为“斥和碑”，竖立于朝鲜首都汉城（今韩国首尔）市中心的钟路，随后命令在朝鲜各地竖立此碑，从而形成举国“斥和”的局面，以此鼓舞民气；又以身作则，从云岘宫拔出衣服和粮食输送给前线将士，还命令上自大臣、下至市民都给前线将士捐衣物，以此鼓舞士气。

镂斐迪的如意算盘是模仿1858年英法联军炮轰大沽口，以为损失更惨重的朝鲜也会像当年清政府那样屈服缔约。6月13日，美方提出释放俘虏，并主动释放了9人，又重申要与朝鲜协商谈判之意，并要求李基祖转递镂斐迪致朝鲜国王的亲笔信，信中敦促朝鲜尽快派人来和美国谈判缔约。在朝鲜政府的授意下，富平府使李基祖以个人名义回信声讨美国，表达朝鲜拒绝协商、血战到底的意志，并且继续以“竹竿外交”的形式进行，在此后一周时间里与美国展开口水战。美方指责李基祖从中作梗、欺瞒国王；李基祖则领受朝廷旨意，向美国人声称他自己只知战守之职分，决不会将镂斐迪亲笔信呈送于国王。到6月20日收到战斗结束后李基祖的第5封书信时，镂斐迪才意识到朝鲜毫无妥协余地、其排外态度不可能转变，他的如意算盘落空了。于是镂斐迪便将剩下几名俘虏全部释放，也停止与朝鲜徒劳地通信，并在6月22日向国务卿菲什拍电报称，最近的示威对协商没有产生任何效果，要奏效的话只能攻击首都，但以目前的兵力而言，前往首都是要冒很大风险的，如果和平交涉失败的话，就请求撤离朝鲜。

此时，朝鲜的处境也很困难。美国舰队的入侵导致漕运被切断、税船上不来，因而汉城物资短缺，造成“谷价日踊、穷夏艰食”的局面。民心也有所动摇，时人记述“都下汹汹，颇有不可镇之势”、“市价倍高，生计没策，内眷出避不知其数”。尽管如此，国王高宗仍表示：“彼船虽百年来侵，我则固守不改；千艘更来，我亦增兵守之”，绝对不会向美国妥协，又说“正气盛则邪气自熄，洋丑之消灭，必有其日矣”。金炳学附和道：“朱夫子（朱熹）云：‘中原之戎虏可逐，一己之私欲难制。’今若守正道、制私欲，则洋丑之出没不足忧，而亦可指日消灭矣。”大院君则大张宴乐，以镇人心。

美军所储备的淡水也逐渐吃紧，而国务院的新训令迟迟不来，镂斐迪便决定撤军。7月2日，美方以杜德绥的名义致信于李基祖，通报撤军，该信在强调美方行动正当性和批评朝方行动的无理性之后，警告朝鲜说：“设或将来各国用强，以致贵君王不能拂其所请，即难言屈抑矣！“7月3日，美国舰队满载战利品撤出朝鲜（还带着辛未洋扰期间投奔美军的10名朝鲜天主教徒），两天后到达中国芝罘（今烟台），为期40余日的“辛未洋扰”遂告结束。

辛未洋扰之后，收拾烂摊子的事落在中国头上。自“丙寅洋扰”以来，中国清政府就对列强侵略朝鲜采取只调停、不干预的消极方针，力求置身事外，一面强调“朝鲜虽系属国，一切政教禁令，皆由该国主持，中国向不过问”并拒绝西方国家让中国对朝鲜行使宗主权以迫使其与西方建交的要求，一面又屡次劝阻西方国家不要勉强朝鲜，因而被后世美国历史学家泰勒·丹涅特形象地称之为“占着茅坑不拉屎的政策”（a dog in the Manger-Policy）。

辛未洋扰结束后，朝鲜政府让朴珪寿撰写了向清政府汇报情况的咨文，是为《历陈美国兵船滋扰情形咨》，附带辛未洋扰期间的朝美往来的书信。该咨文详细陈述了辛未洋扰的来龙去脉，强烈谴责了美国人的侵略行径，并且强调朝鲜虽然可以救助外国失事船员、但是绝对不会同外国协商谈判乃至缔约通商，并称自己“忝备藩屏，殿天子之邦”，在此次事件中尽到了藩属国的义务，又恳请清廷“明降谕旨，使彼国公使洞悉利害，明知两无所益，释虑于遭难拯救，断念于他事交涉，更勿构衅滋扰，各安无事”，最后表示“弊邦世守东藩，久蒙殊眷，视同内服，凡有疾痛，未有不曲轸恩谅，惟恐或伤，帡幪覆焘，天地莫量，今兹忧虞之孔棘，安得不大声疾呼？而冒渎至此，深增兢惶之至”，也就是说，朝鲜的诉求是得到清政府的外交支援，以免再受美国侵略。另外，在辛未洋扰同时也发生了外国船只在朝鲜白翎岛遭难的事件，朝鲜政府将包括中国人和德国人在内的船员以及货物移送来白翎岛的英国军舰（英国误以为其中有英国人，派军舰前往搜救），使之得以回国，并且咨报中国，藉此证明朝鲜不需要同外国谈判缔约就可以救助外国失事船员。

1871年9月10日，清廷礼部收到《历陈美国兵船滋扰情形咨》，虽然清政府对其中“明降谕旨”这种说辞不以为然，但主持总理衙门的恭亲王奕䜣还是按朝鲜的请求，在9月23日会见代理公使卫廉士（S. W. Williams），劝美国对朝鲜收手，并提及了朝鲜的咨文。卫廉士称自己不能做主，并要求中方向美方公开朝鲜咨文全文，总理衙门不给看。

镂斐迪从朝鲜退到芝罘，等待国务院训令。此前他并不太相信中朝之间宗藩关系的效力，但到了朝鲜后收到了4月朝鲜对清廷礼部回咨副本，确认了朝鲜以中国属国自居的事实，因而将他此次远征失败归咎于中国的不作为，甚至怀疑中朝之间对西方国家存在某种默契。他在给国务卿菲什的报告中认为，一旦朝鲜开始和外国交往，中朝宗藩关系势必瓦解，清廷深知这点才会对朝鲜采取消极方针、力图维持现状。9月20日，菲什才向镂斐迪下达训令，对于镂斐迪没能向国王传递亲笔信这点提出批评。不久后镂斐迪回到北京，总理衙门在10月2日给他的照会中仍然只传达朝鲜咨文的两条主旨，即“遭风船只之无待商办”和“通商事件之不必商办”。镂斐迪则在10月10日照会总理衙门，称清政府列举大意、隐瞒全文的行为不合国际惯例，故再次索要《历陈美国兵船滋扰情形咨》。清政府迫于无奈，只好在10月14日将《历陈美国兵船滋扰情形咨》全文抄送镂斐迪。

11月2日，镂斐迪前往总理衙门，就朝鲜问题与恭亲王面谈。镂斐迪在表达了对抄送朝鲜咨文全文的谢意后，接着一一驳斥咨文中的“差谬处”，指出辛未洋扰期间朝鲜行动的无理及美国在军事上的完胜，然后谴责中国身为朝鲜的宗主国却推卸责任，以致朝鲜如此狂妄无知，酿成此次衅端，然后要求清政府负起宗主国的责任，向朝鲜国王传递辛未洋扰期间美国没能传递的镂斐迪亲笔信，被恭亲王拒绝；11月22日，镂斐迪照会总理衙门，在记述了11月2日与恭亲王谈判概要后再次要求中国转递镂斐迪亲笔信。12月23日，总理衙门照会镂斐迪，拒绝帮他转递亲笔信，翌日上奏两宫太后，汇报了中美朝鲜交涉的大致经过，指出“美国思欲借属国二字，令中国势压朝鲜，以遂其谋；朝鲜亦思借属国二字，请中国力制美国，以资庇护”，还强调“朝鲜于上中国文件，居然自行抄给美国，全不隐避，窥其用意，其所谓求中国保护者，并非尽出真忱，不过欲借中国为卸肩地耳。故该两国构衅一事，中国只能从中排解，劝美国不必前往，此外别无可代筹之策”。于是清政府继续对朝鲜与列强的关系奉行只调停、不干预的消极方针，直到1879年后才有所转变。

清政府拒绝转递亲笔信对镂斐迪而言不过是令他更加相信中朝之间对西方国家存在某种默契的判断。他认为只要不让清政府以为美国在军事上输给朝鲜就足够了，此外就没有再与清政府交涉朝鲜问题的必要。辛未洋扰所引发的外交余波就此告一段落。

美国在东亚曾成功施加于中国和日本的炮舰外交竟然没能在朝鲜奏效，自然令镂斐迪和罗杰斯很不甘心。镂斐迪尽管体会到“朝鲜人决心殊死战斗，他们的勇敢是世所罕见的，从来没有一个民族能超过他们”，但是又向国务院主张欧美列强联合远征朝鲜，以迫使朝鲜开放通商；罗杰斯则向海军部建议再次远征朝鲜。他们的建议均未被美国政府采纳。1871年12月14日，美国总统格兰特对国会发表国情咨文，一面祝贺美军在朝鲜获胜，一面对未能同朝鲜缔约表示遗憾，委托国会对朝鲜问题讨论出新的政策。此后朝鲜问题被美国暂时搁置，然而这不意味着他们放弃了对朝鲜的通商要求，在听说日本与朝鲜签订《江华条约》之后，美国于1878年重提与朝鲜缔约事宜，其结果就是1882年《朝美修好通商条约》的缔结。辛未洋扰所未能实现的目标在11年后才得以达成，美国最终还是成为欧美列强中第一个打开朝鲜国门的国家。

在得知美国撤军的消息后，朝鲜君臣总算舒了口气，高宗在先农坛观刈时谈到：“洋舶之退去，为军卒可幸。而不得剿灭，任他远遁，是甚痛叹也！”金炳学说：“臣等俱无智谋，不得殄灭此贼，诚不胜万万悚惶矣。”李裕元也说：“臣等亦以更不得一战为愤恨矣。”其后朝鲜政府决定向全国民众征收“沁都炮粮米”，进一步强化江华岛（即“沁都”）的防备。朝鲜人在经过两次“洋扰”事件后，不再畏惧西方国家，而是更加妄自尊大，紧闭国门；这两次“洋扰”的结果让朝鲜民众产生大院君有能力驱逐洋夷的错觉，从而使大院君的威望如日中天，大院君也被“胜利”冲昏头脑，完全闭目塞听、得意忘形，下令将“斥和碑”竖立在全国各地，还写下“西舶烟尘天下晦，东方日月万年明”这样的豪言壮语。总之，辛未洋扰不仅没能使朝鲜这个“隐士王国”门户洞开，而且还导致其排外情绪达到顶峰，锁国政策也空前强化。

就在朝鲜举国沉浸在斥和攘夷的狂热之际，也有极少数清醒的朝鲜人对于这种“胜利”深感忧虑。辛未洋扰期间，朝鲜对中国的咨文和对美国的照会基本上都出自时任艺文提学的朴珪寿之手，代表着大院君政权的立场，可是朴珪寿本人的主张却与之相反，据说当时他曾对金允植等门人感慨：“吾闻美国在地球诸国中最号公平，善排难解纷，且富甲六洲，无启疆之欲。彼虽无言，我当先事结交，缔固盟约，庶免孤立之患，乃反推而却之，岂谋国之道乎？”但为回避“纳寇卖国之罪”，不得不违心受命替大院君撰写这些外交文书。朴珪寿在给弟弟朴瑄寿的信中也提到美国舰队撤退之际“人皆以为爽快，而吾意则忧虞自此弥深，不知竟当何如也”。持类似观点还有译官吴庆锡，他也看过《海国图志》，却与金炳学们的结论恰恰相反，力主与美国建交。据说吴庆锡就是辛未洋扰时赴美舰“问情”的朝鲜官员之一，把美方信件传递到大院君面前的人也是他，他趁机进言同美国谈判缔约，但遭大院君斥责而被疏远。1874年，吴庆锡随朝鲜使团来华朝贡，秘密拜访了英国驻华公使馆，对使馆中文秘书梅辉立（William Frederick Mayers）抱怨当初美国军队撤得太早，如果再停留两个月，大院君肯定会乖乖就范，因此他认为只有外力才能让朝鲜人开放国门、睁眼看世界，进而请求英国也如法炮制，对朝鲜实施炮舰外交，不过英国人没有答应。吴庆锡等人通过辛未洋扰认识到无法指望大院君来促成朝鲜的“改革开放”，便发展了金玉均、朴泳孝等一批年轻贵族，向他们宣传开化思想，所以辛未洋扰也被视为朝鲜开化党形成的一个契机。

总而言之，击退法、美舰队入侵固然捍卫了朝鲜的主权和尊严，是朝鲜人民爱国主义精神的真实写照，在朝鲜近代史上书写下光辉的一页，但同时也应看到，法、美舰队并不十分强势，且其志在通商，非在吞并朝鲜国土，因此才能在短期内击退。大院君政权由此产生轻敌思想，继续坚持落后的锁国政策，使朝鲜民族失去自主开放的历史机遇。而且大院君击退外敌和加强国防建设的巨大军费开支令朝鲜人民无力负担，表面上巩固了大院君政权，实则激化阶级矛盾，促使其垮台。对外开放已成为不可避免的趋势，加上朝鲜政局的变动，1875年的云扬号事件中，朝鲜终于屈服于日本，签订了不平等的《江华条约》，被迫打开国门，并走上殖民地的道路。由此可见，挫败丙寅洋扰和辛未洋扰对朝鲜来说只是饮鸩止渴式的胜利而已，其结果反而对朝鲜的长远发展产生负面影响。